【中英双语】生物信息学算法完整课!从DNA复制到基因组组装|UCSD经典99讲中文配音
合集 · 算法与数据结构 (14)
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【中英双语】生物信息学算法完整课!从DNA复制到基因组组装|UCSD经典99讲中文配音
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Parts
- P1 · 生物信息学算法01-第1章:在复制起点寻找隐藏信息(上)
- P2 · 生物信息学算法02-第1章:在复制起点寻找隐藏信息(下)
- P3 · 生物信息学算法03-第1章:从生物学洞察到寻找复制起点的算法(上)
- P4 · 生物信息学算法04-第1章:从生物学洞察到寻找复制起点的算法(下)
- P5 · DNA调控基序怎么找?算法从随机植入模式讲起
- P6 · 基序查找算法实战:从植入模式到调控基序的完整解析
- P7 · 生物信息学必看:中位字符串问题,基序发现的核心算法
- P8 · 掷骰子也能找DNA基序?随机化算法硬核解析
- P9 · 生物信息学必看:Gibbs采样如何精准发现DNA调控基序?
- P10 · 随机算法最怕零值?Laplace教你一招解决
- P11 · 基因组测序凭什么改变医学?30亿碱基的秘密一次讲透
- P12 · 图论起源:柯尼斯堡七桥问题,欧拉如何一劳永逸解决?
- P13 · 基因组组装核心算法:报纸爆炸问题揭秘
- P14 · 基因组组装核心难题:如何从碎片重构完整DNA序列?
- P15 · 基因组组装核心难题:如何用哈密顿路径重建DNA序列?
- P16 · 欧拉路径 vs 哈密顿路径:基因组组装算法对决,选错直接崩溃
- P17 · 基因组组装新思路:欧拉路径 vs 哈密顿路径,谁更胜一筹?
- P18 · 欧拉定理:如何找到一笔画路径?图论算法入门
- P19 · 基因组装神器:德布鲁因图如何从碎片重建完整基因组?
- P20 · 基因组组装难题:De Bruijn图为何在现实中频频翻车?
- P21 · 基因组组装歧义怎么破?德布吕因图与配对读段实战拆解
- P22 · 从DNA片段到完整基因组:生物信息学算法如何组装生命蓝图
- P23 · 青霉素的发现颠覆了你的科学课认知!抗生素如何拯救数亿人
- P24 · 细菌如何制造抗生素?从DNA到环肽的全流程揭秘
- P25 · 质谱仪如何测序抗生素?打碎分子称重就能破解环肽密码
- P26 · 暴力算法能破解环肽测序吗?万亿种可能,这方法直接崩了!
- P27 · 分支定界算法如何加速环肽测序?生物信息学核心方法详解
- P28 · 质谱测序遇到噪声怎么办?打分算法让肽段鉴定更鲁棒
- P29 · 从20到100+种氨基酸:生物信息学如何破解非标准氨基酸难题
- P30 · 质谱卷积:让噪声数据也能精准测序的算法突破
- P31 · 质谱仪到底在测什么?光谱真相揭秘,生物信息学必看
- P32 · 破解非核糖体密码:序列比对如何揭示生物奥秘
- P33 · 序列比对游戏:如何用动态规划找出最长公共子序列?
- P34 · 曼哈顿游客问题:从观光路线到序列比对的动态规划思维
- P35 · 动态规划入门:从找零问题看透算法本质
- P36 · 动态规划 vs 回溯:序列比对算法谁更强?
- P37 · 序列比对动态规划:从曼哈顿网格到最长公共子序列
- P38 · 序列比对评分模型大升级:从全局到局部,让比对结果更符合生物学意义
- P39 · 序列比对算法优化:仿射间隙惩罚如何更精准衡量进化距离?
- P40 · 序列比对太耗内存?分治算法实现线性空间比对,长序列也不怕
- P41 · 多序列比对:从双序列到三维动态规划,一次搞懂保守结构域分析
- P42 · 人类基因如何变成老鼠?基因组重排的奥秘
- P43 · 基因组重排算法:4次反转就能把乱序基因变回正常?
- P44 · 断点定理:基因组脆弱区域的关键,生物信息学算法第6章精讲
- P45 · 2-Breaks:用环形染色体巧妙简化基因组重排分析
- P46 · 断点图:基因组重排的核心工具,手把手教你读懂
- P47 · 双断点距离定理:基因组重排的数学核心
- P48 · 肿瘤基因组中的染色体重排:为什么多染色体反而更简单?
- P49 · 人类基因组存在脆弱区域吗?一个反直觉的数学证明
- P50 · 基因组同线性块构建:从点阵图到跨物种比较
- P51 · SARS病毒溯源:谁把致命病毒传给了人类?
- P52 · 从多重序列比对到进化树:距离矩阵如何揭示SARS病毒起源
- P53 · 生物信息学算法实战:基于距离构建系统发育树,从零推导递归算法
- P54 · 生物信息学算法:加性系统发生树重建,从负权重边到完整算法
- P55 · 最小二乘法构建进化树:距离矩阵的最佳拟合
- P56 · UPGMA算法揭秘:如何用超度量树追踪病毒演化路径
- P57 · 邻接算法:被引3万次的生物信息学基础,构建进化树的核心方法
- P58 · 如何用性状重建进化树?生物信息学经典算法
- P59 · 动态规划求解小简约性问题:最小化祖先序列突变
- P60 · 大简约问题:如何找到最省力的进化树?
- P61 · 进化树重建如何破解熊猫身世之谜?从血红蛋白到犯罪追踪
- P62 · 酵母如何进化成酿酒大师?聚类算法揭示基因奥秘
- P63 · 基因表达矩阵:从酵母到癌症,生物信息学如何用数据揭示生命奥秘
- P64 · 聚类算法优化问题:从好聚类原则到K-Means,生物信息学实战
- P65 · K-Means聚类Lloyd算法详解:从原理到酵母基因实战
- P66 · K-means聚类 vs 人眼:为什么算法会看走眼?软聚类如何逼近人类直觉
- P67 · 抛硬币如何引出k-Means聚类?生物信息学硬核算法实战
- P68 · 期望最大化算法:从抛硬币到软聚类,生物信息学核心思想全解析
- P69 · K-means太硬?试试软聚类:从万有引力到统计力学
- P70 · 层次聚类算法全解析:从基因表达到癌症分型,生物信息学必看
- P71 · 基因测序成本暴跌,个人基因组时代来临:Read Mapping如何定位致病突变?
- P72 · 多模式匹配太慢?用Trie树一次扫描基因组,效率提升100倍
- P73 · Trie树内存爆炸?后缀树如何将基因组索引压缩到极致
- P74 · 基因组压缩与Burrows-Wheeler变换:从后缀树到高效模式匹配
- P75 · Burrows-Wheeler变换逆向重建:压缩后如何恢复原始基因组?
- P76 · Burrows-Wheeler变换如何实现高效模式匹配?内存暴降的秘密
- P77 · Burrows-Wheeler变换如何找到匹配位置?后缀数组来帮忙
- P78 · BWT模式匹配加速:检查点数组如何让基因序列搜索快10倍
- P79 · Burrows-Wheeler变换实现模糊匹配:允许错配的DNA序列搜索
- P80 · 双端测序如何检测基因组结构变异?缺失、倒位、易位一网打尽
- P81 · HIV疫苗为何至今难产?隐马尔可夫模型揭示病毒逃逸机制
- P82 · 抛100次硬币63次正面,庄家出老千了吗?用隐马尔可夫模型破解赌局
- P83 · 从作弊赌场到隐马尔可夫模型:HMM核心思想全解析
- P84 · 隐马尔可夫模型解码问题:从零构建曼哈顿图,手把手推导最优隐藏路径
- P85 · 维特比算法:HMM解码问题的动态规划解法,生物信息学必学
- P86 · 生物信息学必看:用Profile HMM精准分类蛋白质家族
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- P88 · 隐马尔可夫模型参数如何自动学习?Viterbi Learning算法详解
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- P94 · 生物信息学必看:肽段测序算法,从质谱到序列的完整解析
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- P97 · 鸵鸟血红蛋白之谜:恐龙蛋白是远古宝藏还是统计巧合?
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Description
为什么学算法的人也该看生物信息学?因为这门课会用「真实生物学问题」带你把动态规划、图论、随机算法、HMM、聚类一路学穿——不是空讲题,而是从「DNA复制起点在哪」一路问到「霸王龙是不是大号鸡」。 本合集为 UCSD《Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach》(Phillip Compeau & Pavel Pevzner)完整中文配音版,共99讲,按教材第1–11章顺序整理。 【你会学到】 · 序列比对 / 动态规划(找零、曼哈顿游客、LCS、全局/局部比对) · 基因组组装(欧拉路径、De Bruijn 图、配对读段) · 抗生素与质谱测序、基因组重排与断点图 · 进化树重建、聚类与基因表达 · BWT / 后缀树与读段比对、隐马尔可夫模型(HIV/蛋白质家族) · 计算蛋白质组学(恐龙蛋白、肽段测序) 【观看说明】 本集为中文配音版(画面保留英文板书,方便对照术语)。 适合:计算机/生物交叉方向、算法课想找应用场景、备战生物信息学入门的同学。 【一点心里话】 这类长课从下载、校对、翻译、配音到渲染,单集就要折腾很久,up主时间精力都有限。 如果这套课真帮到你了,又恰好有能力,欢迎给个充电支持——比白嫖三连更能让系列课持续更下去。 当然,先看完、学明白最重要;充不充电都不影响你安心追更。 喜欢就三连收藏,后续还会继续搬更多海外硬核公开课。